Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21411J3KMS0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms