Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933406M09RikG3XA12 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933406M09RikG3XA12 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms