Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcf11G3X9Z4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Pcf11G3X9Z4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms