Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20517G3UVU6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms