Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6F8VPZ5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6F8VPZ5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms