Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Arid4aF8VPQ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms