Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms