Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms