Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm10563F6WIE4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10563F6WIE4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms