Protein–RNA interactions for Protein: F6T1I5

H2-T10, Histocompatibility 2, T region locus 10, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T10F6T1I5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-T10F6T1I5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-T10F6T1I5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms