Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms