Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms