Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms