Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col22a1E9Q7P1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col22a1E9Q7P1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms