Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms