Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp31E9Q6Y8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms