Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtproE9Q612 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms