Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms