Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930523C07RikE9Q2T4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930523C07RikE9Q2T4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930523C07RikE9Q2T4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930523C07RikE9Q2T4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms