Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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6430550D23RikE9Q1X6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6430550D23RikE9Q1X6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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6430550D23RikE9Q1X6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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6430550D23RikE9Q1X6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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6430550D23RikE9Q1X6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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6430550D23RikE9Q1X6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6430550D23RikE9Q1X6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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6430550D23RikE9Q1X6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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