Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Gm3893E9Q1I1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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