Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r68E9Q0V3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms