Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms