Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms