Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms