Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms