Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3bE9PUL3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms