Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms