Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf217D3YYI7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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