Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc170D3YXL0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms