Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rexo5D3YW29 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms