Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3259D3YUK0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3259D3YUK0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms