Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmf1B9EKI3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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