Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm20547B8JJN0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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