Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam71aB7XG49 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71aB7XG49 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms