Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11cB4XVP9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms