Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms