Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd5B1AYB6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mbd5B1AYB6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd5B1AYB6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms