Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms