Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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