Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll11A4Q9F4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll11A4Q9F4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms