Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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Atp8b5A3FIN4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Atp8b5A3FIN4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Atp8b5A3FIN4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Atp8b5A3FIN4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Atp8b5A3FIN4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Atp8b5A3FIN4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Atp8b5A3FIN4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Atp8b5A3FIN4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Atp8b5A3FIN4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Atp8b5A3FIN4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Atp8b5A3FIN4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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