Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2al1jA2BFR3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms