Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn3aA2ASI5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms