Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms