Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1aA2APX8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1aA2APX8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms