Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin4A2AMM0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms