Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SetxA2AKX3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms