Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Frmpd1A2AKB4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms