Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms